Навесы геноме карт свет на микробной коррозии

Микробами под влиянием коррозии (MIC), явление, которое свирепствует среде, содержащей значительное количество серы в виде серной кислоты (H ^ 2 ^ к югу SO ^ ^ к югу 4), вызывается бактериями, действуя совместно в биопленки, которая охватывает металлических поверхностей. MIC вызвано сульфатредуцирующих бактерий родов Desulfovlbrio и Desulfotomaculum, которые, в анаэробной среде, может пара окисления доноров электронов, таких как H ^ 2 югу ^, органических кислот и спиртов к сокращению сульфата (SO ^ ^ к югу 4), который она использует в качестве окислителя. Они также помогают в биологической очистки токсичных металлов, вызывая металлы как медь (II) в осадок, как сульфиты в водных средах. К настоящему времени реакции вождения эти явления были лишь теоретически.

Однако, недавний прорыв в Институте геномики исследований (ТИГР; Rockville, MD; <a target="_blank" href="http://www.tigr.org" rel="nofollow"> www.tigr.org < />) - секвенирование генома Desulfovibrio вульгарно (Д. vulgarls), один из четырех видов, которые играют важную роль в MIC - может позволить биохимиков для определения реакции схему, по которой сульфатредуцирующих микробов коррозию металла. Эта информация могла бы открыть путь к развитию коррозионно-профилактических технологий, а также способы применения этих и подобных микробов по восстановлению металлических загрязнителей.

Ученые, опубликовавшие результаты своих исследований в мае 2004 вопрос о Nature Biotechnology, атрибут металла снижения способности D. Vulgaris к сети цитохромов типа - белков в цитоплазме клетки, которые способствуют удалению атомов водорода из металлов (железа и стальных труб, как правило, носят жестко проведено фильм водорода на поверхности) - и их транспортировки в сульфат-восстановительная реакция пути. "MIC, как полагают, связаны с дыханием бактерий-энергетического цикла, в котором используется сульфат в качестве акцептора электронов терминал, что привело к образованию сероводорода," говорит Джон Гейдельберг, следователь TIGR которые привели последовательность проекта. Электроны переносятся от поверхности металла до сульфата сокращения путь через промежуточные водорода.

D. Vulgaris, как известно, содержат фермент (гидрогеназы), что позволяет его использовать элементарного водорода к сокращению SO ^ ^ 4 подпункта к югу H ^ 2 ^ С. "Относительное расположение С-типа генов цитохрома кодирования таких ферментов для трансдукции энергии, а также вывод сотовой расположение этих ферментов, прольет свет на микроб использует H ^ 2 ^ к югу велосипеде на повышение эффективности его метаболизма," Heidelberg продолжается . Вклад этих ферментов могут быть изучены с помощью мутагенеза, эксперименты микрочипов или экспрессии генов, а также физиологические характеристики D. обыкновенного, чтобы определить, какие из его гены включить или выключить, когда микроб растет на поверхности металла, и участвует в MIC.