Понять дискретных наноразмерных транспорта
В отличие от макроскопических проблем в массы, энергии и передачи импульса, которые описываются уравнениями континуума, движения и взаимодействия наноразмерных лиц в клетке являются транспортные явления, известного как дискретные наноразмерных транспорта (DNT).
Представьте себя на инопланетного корабля, наблюдая за ежедневной повадки большого города через телескоп. Вы увидите (среди прочего) комплексных транспортных систем, направленных на поддержание надлежащего транспортного потока и эффективного распределения товаров и людей.
Теперь представьте себе, вглядываясь в ячейке под микроскопом. Внутрь клетки населен многочисленными наноразмерных лиц (рис. 1), начиная с 10-25-нм рибосомами, до 100-500-нм эндосомы и лизосомы. Эти подразделения, также известный как клеточных органелл, составляют столько, сколько 15-25% от объема ячейки (см. вставку). Они участвуют в важных клеточных функций, таких как энергоснабжение (митохондрии), производство белков (рибосомы), выступая биохимических продуктов (эндосомы секреторные пузырьки) и хранения переваривается материалов (лизосомы).
Так же, как города, клетки развивались комплекс транспортных систем для обеспечения правильной торговли и распределение этих органелл. Основные биохимических организованных в соответствии с нитями цитоскелета (например, микротрубочек и актиновых филаментов), которые являются основой системы общественного транспорта внутрь клеток. Клеточных органелл являются таща цитоскелета треки молекулярные моторы и общаться друг с другом с помощью специальных протоколов. Во многих аспектах, сложность сотовой транспорта значительно превосходит сложность городского движения - и это не удивительно, так как клетки развивается в течение миллиардов лет, однако большинство модемов метрополий являются не более чем несколько сотен лет.
Движения и взаимодействия этих клеточных органелл составляют отдельный класс явлений переноса, известный как дискретные наноразмерных транспорта (DNT). Здесь термин относится к нано нано-морфологические особенности дискретной лиц транспортировки, и их соответствующие взаимодействия, длина которого масштабе от нескольких до нескольких сотен нанометров. Это отличает нано транспорта от перевозки молекулярного масштаба организации, такие, как ионов, растворенных веществ, метаболитов, липидов и белков (J), и транспортных процессов на уровне целого клеток, таких как сотовые подвижности (2). Транспорт наноразмерных лиц определяется тепловой мобильности, а также их взаимодействия с клеточными структурами (например, нити цитоскелета), с molecularscale лиц (например, моторных белков и сигнальных молекул), а также с другими наноразмерных образований. В большинстве случаев, в связи с дискретным характером транспортных событий и их сильная зависимость от местных конструктивные и архитектурные свойства биологических средах, дискретных наноразмерных перевозки не могут быть описаны континуум подходов, которые обычно используются в механике жидкости и тепла и массы передачи ..
Важно клеточных функций часто связаны с несколькими процессами DNT. Срыв или неисправности DNT наблюдается во многих наследственных и аутоиммунных заболеваний (3, 4). Например, некоторые неврологические заболевания, включая болезнь Альцгеймера, Паркинсона и болезни Хантингтона, были связаны с дефектами молекулярные моторы, неправильной деятельности микротрубочек связанных белков и неудачи в общении между наноразмерных отсеков (3. 5, 6). Количественное понимание наноразмерных транспортных процессов поможет выявить ненормальные шаг торговли (ов) и в разработке терапевтического лечения, которые могут восстановить нормальные функции.
Такие ценные сведения о внутренней работе ячейки также может привести к инновациям в наномедицины и нанотехнологии. Терапевтического успеха наноразмерных устройств (например, нанороботы) и наноразмерных носителей наркотиков (например, наночастицы, липосомы, вирусный капсид, nanoshells и синтетических генов векторов) опирается на способность к карте организации внутрь клетки и перейдите устройств правильный целей. По подражая как органеллы двигаются и взаимодействуют друг с другом, то можно будет внедрять более эффективные наноразмерные системы для биомедицинских целей. В конце концов, можно было бы применить принципах внутриклеточный транспорт, чтобы построить "супрамолекулярных завод" на производство и сборку наноразмерных продуктов (7).
Стремление понять принципы, которые регулируют транспорт и организация наноразмерных образований привлекают интенсивные исследования по многим дисциплинам, таким, как молекулярная биология, биохимия и биофизика. С учетом недавнего появления количественной флуоресцентной микроскопии, движения одиночных молекул и отдельные частицы могут быть отслежены и организации живых клеток могут быть проанализированы в изысканных деталях. Это привело к авансы внутриклеточной динамики макромолекул, цитоскелет основе транспорта и мембранного слияния и деления. Эти новые события внесли значительное влияние на понимание основных клеточных функций, в том числе endocytosis.exocytosis, гомеостаз, внутриклеточной сигнализации и т. д.
В то же время, данные, полученные этими экспериментами богаты и сложны, и выйти за рамки простой интуитивной модели, традиционно используется для объяснения биологических проблем. В настоящее время широко признается, что математические и вычислительные модели необходимо в полной мере использовать богатство информации, представленной в последнее время улучшения в экспериментальных методов. Задача состоит в том, чтобы перевод качественных наблюдений и гипотез в количественном, коренным образом звук и проверяемые модели.
Одна из стратегий, которая широко используется при изучении биохимических сетями, адаптировать инструменты и концепции из технических наук. Химическая технология имеет долгую историю решения сложных явлений переноса в физических системах. Хотя различные по своему характеру, транспортные процессы могут быть изучены в рамках объединяющей рамках континуума уравнений массы, энергии и передачи импульса. Это облегчает применение научных законов, сложных химических процессов, с целью анализа, проектирования и управления ими. Такая система в полной мере соответствует необходимость разработки системного подхода, который сочетает инженерных количественных экспериментов, теоретического моделирования и системного анализа, чтобы понять и предсказать внутриклеточного транспорта, особенно дискретной наноразмерных транспортных процессов.
Основы наноразмерных транспортных процессов: эндоцитоз
Эндоцитоза является процесс, при котором клетки усвоить жидкости и макромолекул. Чтобы понять важность DNT в нормальной работы клеток, рассмотрим транспортные процессы эндоцитоза (рис. 1, коробка).
Клеточной поверхности украшена покрытием ямы, которые постоянно загибается внутрь клетки и разорвать, как budshaped клатрин покрытием везикул (CCVS). Молекулы, большие или малые, что произошло присутствовать в закрытом жидкости или прикрепленные к клеточной мембране или мембранных рецепторов на шахте сайты будут получать вход в клетку. После того как увозили из клеточных мембран, CCVS быстро теряют пальто клатрин и слиться с уже существующей раннего эндосомы (ЕЭС). Внутреннюю грузов сортируется в раннем эндосомы, а некоторые (например, рецепторы), возвращаются к клеточной мембране по утилизации пузырьков. Остальной груз доставляется в конце эндосомы (КП), которые несут ответственность за начало деградации груза и его доставку к лизосомы (рис. 2а). Перевозка эндосомы на микротрубочки рассчитано на питание от kinesin и dyneins, которые движутся их от и к ядру, соответственно. Лизосомы. Последняя остановка, участвуют в окончательному распаду внутреннюю грузов, утилизации продуктов распада и хранения переваривается материала (рис. 2, b) (8, 9) ..
Ходе грузов по внутренним endocytic пути зависит от трех различных наноразмерных процессов, а именно пузыря начинающим, двигатель с помощью движений и слияния мембран, которые отвечают за создание, транспорта и связи наноразмерных образований. Эти процессы также служить в качестве строительных блоков в других важных сотовой путями.
Пузырек почкованием. Значительный прогресс был достигнут на пути к пониманию молекулярных основ пузыря начинающим (10). Было установлено, что ключевым молекулярных компонентов везикул многообещающий процесс белки, пальто многообещающий пузыря. Уникальные белки участвуют на различных этапах по endocytic и секреторных путей.
Вы можете белков (например, известный как Копи и COPII) вербуются для доноров органеллы мембраны из цитоплазмы с помощью специфических белков адаптер (11). Плоская мембрана деформируется в круглые почки из-за взаимодействия между пальто белков, липидного бислоя и несколько белков цитозоля (12).
Пузырек формы, когда на шее, соединяющий ее с донорами поверхности трещин. Этот шаг является относительно простым для Копи и COPII покрытием пузырьков, а энергии на мембранных деления поставляется пальто белков. Для клатрин покрытием пузырьки, она требует ферментативной активности Динамин, который образует воротник или кольцо вокруг шеи многообещающий пузыря (13).
И наконец, пузырек релизы пальто компонентов, которые возвращаются обратно донору мембраны.
Мотор с помощью транспорта. Температуропроводности наноразмерных лиц в цитоплазме, как правило, гораздо меньше, чем объем водных диффузии. Это связано с повышенной вязкостью цитоплазматической среды, извилистость пути диффузии, связанных с ультраструктурные препятствий, а также дополнительные гидродинамических препятствий связанных с конечными размерами частиц. Он часто занимает несколько часов или дней наноразмерных лиц пройти длина клетки путем диффузии.
Для преодоления ограничений, медленная диффузия, клетки используют моторные транспорта на цитоскелета сетей. Два основных вида нитей цитоскелета участвуют в транспорте, а именно микротрубочек и актиновых филаментов. Микротрубочки (МТ) длинные (10-100-м), полярные, нитевидные полимеры с плюс конца и без конца. В неполяризованных клеток, минус концы МТ крепятся к организации микротрубочек центра (ЦОМТ), расположенных в непосредственной близости от ядра, в результате однородного массива MT расширения к ячейке коры (рис. 3). Актиновых филаментов (AFS), как правило, меньше, чем микротрубочки, а также их ориентация случайных всей цитоплазме (14). В большинстве клеток, микротрубочки несут ответственность за дальних перевозок в то время как актиновых филаментов поддержки локальной доставки.
Транспорт на цитоскелета нитей управляется моторных белков, которые преобразуют химический потенциал в механическую работу с высокой эффективностью; kinesins и dyneins транспортировки грузов вдоль микротрубочек, а миозины транспортировки грузов вдоль актиновых филаментов. Деятельности моторных белков, регулируются комплекса сигнализации сетей (15, 16).
Мембранные слияния. Мембранные слияния имеет решающее значение для передачи белков, липидов и растворенных веществ между различными отделениями и экзо-и endocytic движения сигнальных молекул и рецепторов. Многие молекулярных компонентов, участвующих в этой реакции были выявлены и новые белки постоянно открыт.
Концептуально, мембранные слияния состоит из трех основных этапов (17). Во-первых, оба партнера должны пройти в цитоплазму, чтобы встретиться друг с другом. Во-вторых, мембраны должны признать и связывать друг с другом, белково-опосредованный процесс, известный как привязывать. Специфика мембраны привязывая имеет решающее значение для предотвращения нежелательного слияния и сохранить compartimental идентичности. И наконец, слияние происходит за счет формирования пор, соединяющая два соединенный мембран. Пор может быть временной и закрыть после определенного периода времени (так называемое kissand перспективе слияние), или она может вырасти больше, как два партнера, сливаясь, образуют новые лица (прямое слияние) (18, 19). В результате, содержимое везикул 2 обмена или накапливаются в новых везикул.
Экспериментальные исследования в дискретных наноразмерных транспорта
Экспериментальные исследования наноразмерных транспорта можно подразделить на три категории: молекулярном, микроскопические и макроскопические.
В макроскопических экспериментов, конечные точки транспортного процесса измеряется, часто в течение большого числа клеток (как правило, более 10 тысяч) и юридических лиц. Макроскопических опытах часто, предназначенной для тестирования участия выбрали белка в определенных клеточный процесс, для изучения судьбы определенные молекулы в биохимических путей, или изучать свойства особого типа органелл.
Cell-свободный методы используются также для изучения биологии органелл на популяционном уровне. Клеточных органелл, меченных разными индикаторов могут быть извлечены в цельной форме и смешиваются в бесклеточных системах, а затем смешения индикаторов можно пристать. Основным преимуществом такой системы является легкость, с которой окружающей среды можно управлять - в том числе концентрации ионов и рН. Cell-свободных тестов были использованы лошадкой несколько крупных лабораторий для исследования взаимодействий между органеллы вдоль endocytic и секреторных путей (20, 21).
Демографические методы были и остаются основным путем зондирования важных внутриклеточных процессов. Однако их применение в изучении внутриклеточного транспорта ограничено, главным образом потому, что они не дают количественных данных о поведении наноразмерных структур на индивидуальном уровне.
Последние достижения в области визуализации на микроскопическом уровне, позволили исследователям следить в реальном времени движения органелл внутри живых клеток с субмикронной 3-мерного пространственного разрешения и с временным разрешением так быстро, как миллисекунд. Полезные данные о транспортных свойствах, например, скорости и частоты направленного транспорта, сообщили в различных системах (22-24). Интересно, что многие органеллы стремятся двигаться в двух направлениях на микротрубочки, используя kinesins и dyneins в быстрой последовательности (25). Наиболее поразительно то, как они были недавно сообщили, что зависит от микротрубочек перевозки эндосомы не только двунаправленный, но и симметричной, а перемещениями людей в результате kinesins и dyneins к противоположных концах МЦ примерно одинаковы (в среднем ансамбль смысле), как показано на Рис 3 (22). Эти случайные блуждания эндосомы к обоим концам привести к форме облегченной диффузии и привести к единому дисперсии эндосомы по радиальной координате клетки ..
Цель молекулярной экспериментов, чтобы определить, охарактеризовать и манипулировать молекулярных компонентов (например, моторных белков, опосредующих белков сигнальных молекул и т.д.), которые регулируют процессы интересов. Молекулярная экспериментов эффективный способ подорвать основополагающие механизмы клеточных процессов, а также может быть интегрирована с макро-и микроскопические эксперименты показывают целостное понимание наноразмерных транспорта.
Теоретические исследования в дискретных наноразмерных транспорта
В настоящее время в сложившейся парадигмы моделирования наноразмерных транспорта фармакокинетических моделей, приближенных событий людьми, в том числе, связанных с транспортом шагов, кинетического процессов характеризуется константами скорости. Это дает обыкновенных дифференциальных уравнений (ОДУ), которые описывают концентрации видов интерес в различных сотовых отсеков.
Кинетические модели были успешно использованы для описания внутриклеточных торговли ряда наноразмерных образований, в том числе вирусов и синтетических векторов. Тем не менее, многие характерные динамические события, такие как microtubuledependent транспорта, не описаны надлежащим образом, когда транспортные процессы накладываются на кинетических уравнений.
Пространственная организация внутри клеток, также не является надлежащим образом учтены в кинетической модели. Поскольку реальная скорость реакции зависит от локальной концентрации наноразмерных лиц (а не compartmentally усредненной концентрации как они определены в кинетической модели), правильного описания пространственной организации, необходимые для отражения градиенты концентраций вызвано транспорта и клеточной организации.
Таким образом, существует заинтересованность в разработке нового подхода к моделированию, который улавливает присущие свойства динамики транспорта и предсказывает, пространственно-временного поведения, и которые могут быть непосредственно сопоставлены с данными, полученными от микроскопических экспериментов.
В последнее время феноменологических моделей дискретных наноразмерных транспорта было уделено значительное внимание (22, 26-35). На основе этих моделей является концепция нескольких государств, транспорт, изначально разработанный Смит и Симмонс (30) и Малый (28), которая приближается перемещения наноразмерных лиц как стохастические траектории отдельных частиц, которые периодически переключаться между различными видами транспорта, например, , распространения и направленного транспорта. Номера переключения и свойства транспорта непосредственно оценить частиц отслеживания экспериментов. Теории многих государственных транспортных была утверждена на широкий спектр систем (22, 34, 35). В частности, 4 классов organeHe модели были названы - агрегации, гипер-дисперсии, дисперсии лучевых и площадных дисперсии - и появление каждого шаблона может быть предсказано с помощью двух Пекле номера (35).
Хотя важно понимать отдельные процессы переноса и взаимодействия между органеллы, в равной степени важно для интеграции и для изучения этих процессов в контексте системы и наблюдать, как они влияют на клеточные функции в целом. В последнее время предпринято несколько попыток интегрировать теории нескольких штатах транспорта с математическими моделями других клеточных процессов (например, сигнальные пути, экспрессия генов) привели к более глубокому пониманию многих явлений на клеточном уровне, такие как цвет адаптации, вирусные инфекции и Доставка синтетических генов. В частности, системы, инструменты (такие, как оптимизация и анализ чувствительности (36)) может быть применена к предоставлять полезную информацию о том, как определенной конфигурации системы выбирается эволюции.
Возможности для инженеров-химиков
Исследования наноразмерных транспорта переживает бурный рост в последние два десятилетия. Однако, исследования сильно раздроблены, и систематическое понимание вопроса еще не вышла. Кроме того, мало внимания уделялось пространственным и организационных аспектов, оба из которых играют ключевую роль в обоих диагностики и контроля наноразмерных транспорта.
Мы считаем, что важно развивать пространственных систем зрения наноразмерных транспорта, как показано на рисунке 4. Такой подход может выявить причинно-следственную связь между взаимодействий на нано-и молекулярно-весы, пространственная организация, которая возникает из этих взаимодействий, и функциональность этой организации.
Инженеры-химики идеально подходит для проведения таких расследований. Мы не только хорошо подготовленные в механике жидкости, массоперенос, реакции кинетики и математического анализа, но мы также привыкли иметь дело с тем исследований междисциплинарного характера. Кроме того, знакомые химического машиностроения таких понятий, как реакция-диффузия-перенос, демографический баланс, оптимальное управление, чувствительности и т.д., которые непосредственно применимы ко многим ситуациям. Благодаря сочетанию количественных экспериментов, теоретических моделей и систем анализа, инженеры-химики могут найти общий свод правил, общих учредительных законы, и даже универсальные принципы этих сложных, но увлекательных, явлений транспорта.
Изучение наноразмерных транспорта также открывает множество возможностей в области нанотехнологий. В последнее время несколько групп, которые используются микротрубочек на микро-узорной поверхности построить наноразмерные системы железных дорог, в комплекте с поезда, пути и станции (37, 38). Молекулярные челноки основывается на принципах двигателя с помощью транспорта потенциал для расширения лаборатории-на-чипе парадигмы nanofluidics, позволяя активным, режиссер и избирательного переноса молекул и наночастиц.
Методология, которая интегрирует количественных флуоресцентной микроскопии, реконструкции изображения, стохастического моделирования, анализа чувствительности и численной оптимизации была разработана с целью выявления и количественной оценки лимитирующей шаги по пути доставки синтетических носителей гена (36). Моделирование служит в качестве основы трехмерной динамической карты во внутриклеточное пространство. Анализ свидетельствует о влияния нескольких клеточных специфические свойства, такие, как топология (размер, округлость и размерность), на эффективность поставок синтетических векторов. На основании сравнения с доставки генов вирусов, несколько стратегий, было предложено значительно улучшить эффективность трансфекции синтетических векторов. В конечном счете, лучше понять дискретных наноразмерных транспорта в различных клеточных линиях может преобразовать как наноразмерных наркотиков систем доставки разработаны и оптимизированы.
ЛИТЕРАТУРА
1. Ниче, JM, "Клеточные процессы Microtransport: межклеточные, внутриклеточные. И совокупное поведение" Энн Rev Biomed Eng. 1, с. 463-503 (1999).
2. Митчисон, TJ, Л. П. Крамер, "Actin основе подвижности клеток и Locomotion", Cell, 84, с. 371-379 (1996).
3. Aridor, М. и Л. Ханнан, "Traffic Jam: справочник по населенным болезней, которые поражают внутриклеточные процессы переноса," Торговля, 1, с. 836-831 (2000).
4. Aridor, М. и Л. Ханнан, "пробки II: Обновление Болезни внутриклеточного транспорта," Торговля, 3, с. 781-790 (2002).
5. Ebneth, А. и др. /. ", Экспрессия белка Тау Угнетает Kinesin, зависящих от торговли пузырьков, митохондрий и эндоплазматического ретикулума: последствия для болезни Альцгеймера," J Сотовый биологии, 143, с. 777-794 (1998).
6. Стены, H, W., и др.., "Молекулярные аспекты болезни Хантингтона," J Neurosci Res, 54, с. 301-308 (1998).
7. Стефанопулос, N., и др.. ", Наноразмерные инженерных систем процесс: на пути к молекулярной фабрики. Синтетические клетки, и адаптивные устройства," Айше J, 51, с. 1858-1869 (2005).
8. Мелман, И. ", эндоцитоза и молекулярной Сортировка" Энн Rev Сотовый Dev биологии, 12, с. 575-625 (1996).
9. Wattiaux, Р. и др. /. ", Эндосомы Лизосомы: их значение в перенос генов". Adv наркотиками Deliv Rev, 41, с. 201-208 (2000).
10. Bonifacino, JS, и Б. С. Глик, "Механизмы везикул бутонизации и Fusion", Cell, 116, с. 153-166 (2004).
11. Kirchhausen, T., "Адаптеры для Клатрин опосредованного движения" Энн Rev Сотовый Dev / / Биол. 15, с. 705-732 (1999).
12. Farsad, К. и П. Де Camilli, "Механизмы деформации мембраны, Керр" ОПИН "Сотовый биологии, 15, с. 372-381 (2003).
13. Kirchhausen, T., "Три способа сделать Пузырек," Nat Rev Мол биологии клетки, 1, с. 187-198 (2000).
14. Снайдер, J., и др.. ", Внутриклеточные Actin основе Транспорт: Как далеко You Go зависит, как часто вы Switch". Proc Natl Acad Sci США, 101, с. 13204-13209 (2004).
15. Rellein, AR, и др.., "О регулировании белки Мотор". Im Rev Cytol, 204, с. 179-238 (2001).
16. Маллик, Р. и С. П. Гросс, "Молекулярная Motors: Стратегии Get Along", Керр биологии, 14, с. R971-982 (2004).
17. Яна, Р. и Н. Grubmuller, "Мембрана Fusion", Керр "ОПИН" Сотовый биологии, 14, с. 488-195 (2002).
18. Яркий, Н. А. и др.. ", Endocytic Доставка Лизосомы посредничестве Параллельное Fusion и Kissing События в живых клетках." Керр биологии, 15, с. 360-365 (2005).
19. Харата, NC, и др.., "Kiss-и-Рана и полного коллапса Fusion, как режимы Exo-эндоцитоза в нейросекреции," J Neurochem, 97, с. 1546-1570 (2006).
20. Шмид, JA, и др.., "In Vitro Fusion тканевой произведенными эндосомы и лизосомы, Eur J Сотовый биологии, 77, с. 166-174 (1998).
21. Бланшетт, JM, и др.. ", Бесклеточных Восстановление транспорта по транс-Гольджи сеть до позднего Эндосома / Prevacuolar отсека. J Biol Chem, 279, с. 48767-48773 (2004).
22. Pangarkar, К., и др.., "Динамика и Пространственная организация эндосомы в клетках млекопитающих, Phys Rev латыш, 95, стр. 158 101 (2005).
23. Zaliapin, И. и др. /. ", Многомасштабная анализ тенденций микротрубочек Транспорт в меланофоры", ВюсЬет J, 88, с. 4008-4016 (2005).
24. Schutz, ГДж и др.., "Визуализация везикул транспорта вдоль и между отдельными Подготовка в Neurites живых клеток". Microsc Рез Tech, 63, с. 159-167. (2004).
25. Вельте, MA, "Двунаправленная транспорта вдоль микротрубочки," Керр биологии, 14, с. R525-537 (2004).
26. НЕДЕЛЕК, Ф. и др. /., "Динамические Концентрация Motors в Микротрубочки массивы", Phys Rev латыш, 86, с. 3192-3195 (2001).
27. Klimpp, С. и Р. Lipowsky "Активный диффузии частиц Мотор", Phys Rev латыш, 95, стр. 268 102 (2005).
28. Малый, IV, "Стохастическая модель по образцу из цитоплазмы скачкообразное движение" J Теор биологии, 216, с. 59-71 (2002).
29. Слепченко, Б. М. и др.. ", Вычислительная биология Cell: Пространственно-временная моделирование клеточных событий", ВюсЬет Энн Rev Biomol Struct, 31, с. 423-441 (2002).
30. Смит, Д. и Р. Симмонс, "Модели" Мотор-Помощь транспорта внутриклеточной частицы ", ВюсЬет J, 80, с. 45-68. (2001).
31. Клампп, С. и др. /., "Self-организованной Плотность Выкройки молекулярной Motors в массивах цитоскелета Нити", ВюсЬет J, 88, с. 3118-3132. (2005).
32. НЕДЕЛЕК, FJ, и др.. ", Самоорганизации микротрубочек и Motors," Природа, 389, с. 305-308 (1997).
33. Lipowsky, Р. и др. /., "Случайные блуждания цитоскелета Motors в открытых и закрытых отделений" Phys Rev латыш, 87, стр. 108 101 (2001).
34. Динь, AT, и др., "Модель для внутриклеточного торговли аденовирусных векторов", ВюсЬет J. 89, с. 1574-1588 (2005).
35. Динь, AT, и др.., "К теории пространственных структур внутриклеточных органелл". ВюсЬет J, 90, с. L67-69. (2006).
36. Динь, AT, и др.. "Понимание внутриклеточный транспорт процессов, имеющих отношение к синтетическим доставки генов с помощью стохастического моделирования и анализа чувствительности", ВюсЬет J, 92, с. 831-846 (2006).
37. Nitta, Т. и др.., "Моделирование движения молекулярной Трансфер: на пути к автоматизированного проектирования наноразмерных систем транспорта," Лаборатория Chip. 6, с. 881-885 (2006).
38. Цзя, L., и др.. ", Микромасштабные транспорта и Сортировка по Kinesin молекулярной Motors," Биомед микроприборов, 6, с. 67-74 (2004).
Туан Ань-Динь
CHINMAY PANGARKAR
САМИР MITRAGOTRI
Университет Калифорнии, Санта-Барбара
Туан Ань-Динь является ученый Архимед Инк (201 Миссия ул 29-м этаже, San Francisco, CA 94105, E-почта: <a href="mailto:tuan.dinh@archimedesmodel.com"> tuan.dinh @ archimedesmodel.com </ A>), где он разрабатывает вычислительных моделей для болезней, включая рак и диабет. Он имеет более 10 лет lhan опыт в области разработки вычислительных моделей для сложных систем, начиная от атомных электростанций физиологии человека на клеточном и субклеточном процессов. Его исследовательские интересы лежат вычислительной медицины, системной биологии, биоинформатики и внутриклеточного транспорта. Динь получил степень магистра в механической и ядерной инженерии Королевский технологический институт, Стокгольм, Швеция, а также докторскую степень в области химического машиностроения Univ. Калифорнии в Санта-Барбаре. Он является членом Айше.
CHINMAY PANGARKAR является докторской сотрудник Lawrence Berkeley National Laboratory (<a href="mailto:chpangarkar@lbl.gov"> <chpangarkar@lbl.gov />). В настоящее время его исследования направлены на понимание последствий внеклеточной среды на механическое поведение нейронных стволовых клеток. Другие его научные интересы включают сотовой изображений, системная биология и внутриклеточного транспорта. Pangarkar получил степень бакалавра наук в области химического машиностроения Univ. Мумбаи, Индия, а также докторскую степень в области химического машиностроения Univ. Калифорнии в Санта-Барбаре. Он является членом Айше.
САМИР MITRAGOTRI является профессором химического машиностроения в Univ. Калифорнии в Санта-Барбаре (факультет химического машиностроения, Univ. Калифорнии, Санта Барбара, Калифорния 93106, телефон: (805) 893-7532, факс: (805) 893-5774, E-почта: <A HREF = " mailto: samir@engineering.ucsb.edu "> samir@engineering.ucsb.edu </ A>).
Его научные интересы включают в себя разработку новых методов доставки лекарств, особенно безболезненным и удобных для пациента альтернативы иглы методов, основанных на администрирование терапевтических белков и вакцин. Его группа также работает на понимание процессов переноса в биологических систем на основе экспериментальных и теоретических исследований. Он получил степень доктора наук в области химической инженерии в Массачусетском технологическом институте. Он является членом Айше.
